辞职报告提交后老板扣工资，特殊情况会影响结果：
1、若劳动合同约定服务期且劳动者违约。因服务期内辞职违反约定，老板扣工资用于支付违约金是合法的，这与普通辞职扣工资情况不同。
2、若未提前通知且造成重大经济损失。劳动者未提前30日（试用期3日）通知离职，且因突然离职致单位生产经营受严重影响（如重要项目停滞造成重大损失），单位可依规扣除部分工资赔偿损失，但扣除比例和金额受法律限制，此时扣工资可能合法。
3、若双方书面约定辞职后扣部分工资作为补偿。劳动者与老板协商一致并签订书面协议，约定从工资中扣除部分作为补偿（如合法约定服务期的培训费用分摊等），在协议内容合法的前提下，扣工资有效。
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辞职报告交后老板扣工资，劳动者可能面临以下法律风险：
1、单位以“未完成工作交接”拒付全部工资。虽劳动者有交接义务，但单位不能以此为由全额克扣工资，仅可在造成损失时按规定扣部分工资，否则劳动者可能无法及时足额拿到工资。
2、老板扣工资后，劳动者超仲裁时效维权。若劳动者在扣工资发生后超一年未维权，因仲裁时效为一年（从知道或应当知道权利被侵害时起算），其仲裁请求可能不被支持，无法追回被克扣工资。
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辞职报告交后老板扣工资是否合法，需具体情况判断：一般情况下不合法，但有特殊情形。
若劳动者已提前30日（试用期3日）书面通知解除劳动合同，且无因本人原因给单位造成经济损失，老板扣工资不合法。
若劳动者未提前通知给单位造成实际经济损失，单位可按约定要求赔偿，但每月扣除部分不超当月工资20%，且剩余工资不低于当地月最低工资标准。
若劳动合同明确约定未提前通知辞职需支付违约金（仅限服务期和竞业限制情形），老板扣工资作为违约金可能合法，否则不合法。
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辞职报告交后老板扣工资是否合法，可依法分析：
《中华人民共和国劳动法》第五十条规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”《工资支付暂行规定》第十六条规定：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”
若劳动者已依法提前通知且未给单位造成经济损失，老板扣工资直接违反《劳动法》第五十条“不得克扣”规定；若未提前通知致单位损失，单位可依据《工资支付暂行规定》第十六条扣除工资，但需满足比例和最低工资限制，否则违法。综上，除劳动者未提前通知造成损失且按规定扣除的合法情形外，辞职报告交后老板扣工资均不合法。

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